Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Apool-202ENSMUST00000113415 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm11787-201ENSMUST00000121996 1050 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm8158-201ENSMUST00000219220 465 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm8249-201ENSMUST00000219225 465 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm8112-201ENSMUST00000219637 465 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 AC158142.2-201ENSMUST00000227892 635 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Sprr2f-201ENSMUST00000050397 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Cnot2-203ENSMUST00000105267 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Mat2a-201ENSMUST00000059472 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm10647-201ENSMUST00000098612 2036 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm42503-201ENSMUST00000199080 3706 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Dmtf1-207ENSMUST00000183973 2408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr48-202ENSMUST00000214428 3848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Adgre1-201ENSMUST00000004850 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm6818-201ENSMUST00000190556 2558 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm45520-201ENSMUST00000210109 2031 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Mdm4-202ENSMUST00000067429 3490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm44039-201ENSMUST00000204192 2246 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Trappc8-206ENSMUST00000225661 5191 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Zfp874a-202ENSMUST00000075255 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm24499-201ENSMUST00000158446 104 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm43744-201ENSMUST00000196387 688 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 AC132232.1-201ENSMUST00000214667 1019 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 AC138290.2-201ENSMUST00000218822 369 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm19154-201ENSMUST00000223330 940 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Magea5-202ENSMUST00000169540 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 AC130661.1-201ENSMUST00000218248 1680 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Anks4b-201ENSMUST00000033201 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Vps8-207ENSMUST00000122235 2521 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Cyp4a10-201ENSMUST00000058785 2109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf22-201ENSMUST00000075588 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 AC158938.1-201ENSMUST00000225372 6720 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Limd1Q9QXD8 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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