Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm29228-201ENSMUST00000185489 418 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Klra14-ps-202ENSMUST00000203601 1104 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Reg3d-203ENSMUST00000205240 544 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Reg3d-201ENSMUST00000089667 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Vmn1r216-203ENSMUST00000228389 10213 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm38265-201ENSMUST00000193479 3766 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr38-202ENSMUST00000215796 2782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Vmn1r5-203ENSMUST00000228276 3188 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm15603-201ENSMUST00000119252 492 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm13092-201ENSMUST00000136346 260 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Vmn1r-ps71-201ENSMUST00000172648 924 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm4214-201ENSMUST00000174451 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Esp23-201ENSMUST00000178532 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm6802-202ENSMUST00000186566 126 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm43774-201ENSMUST00000196327 878 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr603-201ENSMUST00000071844 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm42455-201ENSMUST00000199761 2736 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm13757-201ENSMUST00000126038 4460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr365-203ENSMUST00000218602 5374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm43320-201ENSMUST00000196047 2916 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 A930041C12Rik-201ENSMUST00000149156 537 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Ipcef1-209ENSMUST00000170680 1174 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm28263-201ENSMUST00000185884 400 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm37670-201ENSMUST00000193622 229 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm38334-201ENSMUST00000195060 313 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 Gm20074-201ENSMUST00000208144 484 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 AL513022.1-201ENSMUST00000220489 504 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 AC159622.3-201ENSMUST00000221010 361 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Ccdc47Q9D024 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC5□□□□□ -1.61
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