Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r-ps126-201ENSMUST00000117681 926 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 1700034E13Rik-202ENSMUST00000118724 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm22211-201ENSMUST00000158097 156 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm29513-201ENSMUST00000185741 202 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Trbv28-201ENSMUST00000192804 264 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Cep295-208ENSMUST00000161132 7605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Abcg3-201ENSMUST00000031239 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Fat2-202ENSMUST00000108864 14423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Atg4aQ8C9S8 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Atg4aQ8C9S8 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Atg4aQ8C9S8 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm8653-201ENSMUST00000163096 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r117-201ENSMUST00000166937 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm6164-201ENSMUST00000169774 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Atg4aQ8C9S8 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Atg4aQ8C9S8 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 A730009L09Rik-201ENSMUST00000209558 2512 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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Atg4aQ8C9S8 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Atg4aQ8C9S8 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Atg4aQ8C9S8 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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Atg4aQ8C9S8 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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Atg4aQ8C9S8 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr724-202ENSMUST00000213390 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 AC131100.2-201ENSMUST00000227701 998 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Atg4aQ8C9S8 Vmn1r89-201ENSMUST00000053008 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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