Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Pdzrn3Q69ZS0 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Pdzrn3Q69ZS0 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm14887-201ENSMUST00000119522 663 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pdzrn3Q69ZS0 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pdzrn3Q69ZS0 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pdzrn3Q69ZS0 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pdzrn3Q69ZS0 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Pdzrn3Q69ZS0 AC154840.1-201ENSMUST00000225216 408 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
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