Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm24781-201ENSMUST00000157636 117 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm26321-201ENSMUST00000157740 242 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm43689-201ENSMUST00000195951 427 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Obox4-ps25-201ENSMUST00000199090 210 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Tsr1Q5SWD9 Gm2221-201ENSMUST00000209342 418 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 AC131033.1-201ENSMUST00000228223 279 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Olfr1009-201ENSMUST00000055517 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Tsr1Q5SWD9 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Ccar1-211ENSMUST00000219527 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Tsr1Q5SWD9 Kcnj16-205ENSMUST00000178798 3678 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Tsr1Q5SWD9 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
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Tsr1Q5SWD9 AC147615.2-201ENSMUST00000219876 2154 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Tsr1Q5SWD9 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Tsr1Q5SWD9 Gm17203-201ENSMUST00000164379 4017 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Tsr1Q5SWD9 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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Tsr1Q5SWD9 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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Tsr1Q5SWD9 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm13642-201ENSMUST00000121697 381 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
Tsr1Q5SWD9 Gm13715-201ENSMUST00000136578 411 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
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