Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm11581-201ENSMUST00000122024 763 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm14272-201ENSMUST00000133525 484 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 4933407I08Rik-201ENSMUST00000151215 1294 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm27178-201ENSMUST00000184962 340 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
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Rnf40Q3U319 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Rnf40Q3U319 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Rnf40Q3U319 Cnot2-213ENSMUST00000169921 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
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Rnf40Q3U319 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Rnf40Q3U319 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Rnf40Q3U319 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
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Rnf40Q3U319 Ncoa7-212ENSMUST00000217644 2256 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm29515-201ENSMUST00000188273 2077 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Abcc2-201ENSMUST00000026208 8027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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Rnf40Q3U319 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm26014-201ENSMUST00000104405 132 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm13604-201ENSMUST00000119332 482 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Stau2-209ENSMUST00000145092 564 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Rnf40Q3U319 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
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