Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Cdk14-203ENSMUST00000115451 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr1117-ps1-201ENSMUST00000118736 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Amd-ps1-201ENSMUST00000120127 994 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm18342-201ENSMUST00000186987 694 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Ly6a-203ENSMUST00000187171 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm2427-201ENSMUST00000189121 881 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm37184-201ENSMUST00000194720 650 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm33758-201ENSMUST00000199230 407 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm44132-201ENSMUST00000205142 151 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Abca15-204ENSMUST00000207220 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC127337.1-201ENSMUST00000220423 625 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC141642.1-201ENSMUST00000220598 229 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr1467-201ENSMUST00000054687 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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Usp39Q3TIX9 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Vmn1r52-201ENSMUST00000079832 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr598-201ENSMUST00000098202 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm23133-201ENSMUST00000104255 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm11677-201ENSMUST00000121349 977 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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