Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm3496-201ENSMUST00000188283 745 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm17777-201ENSMUST00000189740 1276 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm3338-201ENSMUST00000220982 269 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC129308.2-201ENSMUST00000224588 789 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm37407-201ENSMUST00000194793 1316 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC121997.2-203ENSMUST00000228613 4192 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Btbd35f10-201ENSMUST00000178621 1952 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Vmn1r80-209ENSMUST00000228578 11005 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Chrdl1-201ENSMUST00000063029 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm37006-201ENSMUST00000195253 2674 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr1318-201ENSMUST00000058176 1690 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm12486-201ENSMUST00000120887 541 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Myhas-202ENSMUST00000145021 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm26187-201ENSMUST00000157693 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm29320-201ENSMUST00000185235 615 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm29179-202ENSMUST00000186138 615 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm29448-201ENSMUST00000186675 615 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm29314-201ENSMUST00000186800 615 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm28253-202ENSMUST00000187971 615 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm29169-201ENSMUST00000189835 615 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm38250-201ENSMUST00000192691 766 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm46401-202ENSMUST00000223425 803 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC129219.3-201ENSMUST00000223790 196 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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