Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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PdgfraP26618 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Nufip2-201ENSMUST00000100802 5158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PdgfraP26618 Zfp808-201ENSMUST00000099449 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PdgfraP26618 Gm11262-201ENSMUST00000119326 833 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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PdgfraP26618 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm12195-201ENSMUST00000144990 469 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm14549-201ENSMUST00000154993 1035 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PdgfraP26618 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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PdgfraP26618 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PdgfraP26618 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PdgfraP26618 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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PdgfraP26618 Olfr178-203ENSMUST00000215032 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PdgfraP26618 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PdgfraP26618 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PdgfraP26618 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Olfr1053-201ENSMUST00000099897 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm28445-201ENSMUST00000187686 1498 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Zfp980-201ENSMUST00000105738 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PdgfraP26618 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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