Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm20162-201ENSMUST00000193629 871 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm37202-201ENSMUST00000193679 361 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 AC113198.1-201ENSMUST00000226353 832 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Defb2-201ENSMUST00000006745 305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm22265-201ENSMUST00000082947 116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Tbc1d32-201ENSMUST00000099739 7240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr1254-201ENSMUST00000099764 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Fbxw15-201ENSMUST00000056745 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Rnf213-201ENSMUST00000093902 16716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Ktn1-203ENSMUST00000185940 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Ktn1-208ENSMUST00000187039 3875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm38375-201ENSMUST00000194610 2227 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm26764-201ENSMUST00000181175 2596 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm26144-201ENSMUST00000104475 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr407-ps1-201ENSMUST00000117794 866 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gng2-ps1-201ENSMUST00000120523 217 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm16086-201ENSMUST00000143652 371 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm23149-201ENSMUST00000158837 230 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr296-ps1-201ENSMUST00000173904 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm42886-201ENSMUST00000199214 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm44091-201ENSMUST00000205212 649 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm44992-214ENSMUST00000210787 1079 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 AC154598.1-201ENSMUST00000227079 347 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Wdr83os-201ENSMUST00000079764 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm22364-201ENSMUST00000083097 98 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Gm43437-201ENSMUST00000198535 3955 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Dsc1-202ENSMUST00000224432 4085 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Btbd35f2-201ENSMUST00000179991 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PrkcaP20444 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms