Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr55-204ENSMUST00000216633 4758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Dmxl1-201ENSMUST00000041772 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Zfp106-211ENSMUST00000171215 6391 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Celf2-201ENSMUST00000002176 7718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm16170-201ENSMUST00000156882 3754 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Fancd2-201ENSMUST00000036340 5512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Hc-201ENSMUST00000028233 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr31-203ENSMUST00000217035 4126 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm15967-201ENSMUST00000120027 1116 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm23206-201ENSMUST00000122720 184 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm27854-201ENSMUST00000175578 244 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm29045-201ENSMUST00000187278 698 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm5734-201ENSMUST00000189787 913 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm20926-201ENSMUST00000194457 696 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm42729-201ENSMUST00000201770 2930 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Tmem45b-204ENSMUST00000217007 783 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Nckap5-203ENSMUST00000094610 739 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr657-201ENSMUST00000098171 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Agbl2-202ENSMUST00000037219 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 AC151971.5-202ENSMUST00000215946 3188 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm37894-201ENSMUST00000195416 2599 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr1357-202ENSMUST00000203305 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Slc28a2-201ENSMUST00000028652 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Adam39-201ENSMUST00000066814 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Erap1-201ENSMUST00000169114 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Vmn1r33-202ENSMUST00000227418 2414 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Zfp78-201ENSMUST00000086323 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Vmn1r71-209ENSMUST00000228526 5137 ntAPPRIS P2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PdgfaP20033 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms