Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm44214-201ENSMUST00000204153 606 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 AC125539.2-202ENSMUST00000227983 587 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 1110032A03Rik-202ENSMUST00000042576 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr1465-202ENSMUST00000207340 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Vmn1r1-202ENSMUST00000227586 3766 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 D5Ertd577e-201ENSMUST00000094593 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Etv1-202ENSMUST00000159334 3981 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Homer1-202ENSMUST00000079086 4287 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Vmn2r24-201ENSMUST00000075095 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gabra6-203ENSMUST00000155218 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm15647-201ENSMUST00000160178 691 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Rian-217ENSMUST00000183266 687 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 1700001D01Rik-201ENSMUST00000188654 565 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm8125-201ENSMUST00000216602 738 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm23970-201ENSMUST00000083319 107 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm43891-201ENSMUST00000205132 3112 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
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PtpraP18052 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm9496-201ENSMUST00000191295 1601 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PtpraP18052 AC154640.4-201ENSMUST00000226647 4640 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Elf1-204ENSMUST00000227192 3765 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 1700019J19Rik-202ENSMUST00000213583 1856 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Ncoa7-203ENSMUST00000213836 2989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr2-205ENSMUST00000214105 5798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm13023-201ENSMUST00000085144 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Zfy2-202ENSMUST00000187148 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PtpraP18052 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms