Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm7073-201ENSMUST00000114687 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC5□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm13491-201ENSMUST00000118267 235 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Vmn1r-ps1-201ENSMUST00000118738 573 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm24962-201ENSMUST00000157917 109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm38149-201ENSMUST00000191943 339 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm9973-202ENSMUST00000220926 166 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Slc22a22-201ENSMUST00000022995 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm19176-201ENSMUST00000222149 1831 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Xlr4d-ps-201ENSMUST00000118894 646 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm14939-201ENSMUST00000120347 680 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm16566-201ENSMUST00000160387 910 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
XntrpcF8VQM8 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms