Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5689-201ENSMUST00000041389 294 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1133-201ENSMUST00000099855 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11698-201ENSMUST00000117948 455 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csmd3-209ENSMUST00000162830 13012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38240-201ENSMUST00000195110 2487 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7903-201ENSMUST00000113172 3677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5128-201ENSMUST00000113173 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14649-201ENSMUST00000121814 324 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm25456-201ENSMUST00000157952 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8035-201ENSMUST00000204625 687 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC091683.1-201ENSMUST00000222307 2446 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7195-201ENSMUST00000190869 1707 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Skint4-201ENSMUST00000069769 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15076-201ENSMUST00000117076 474 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl31-ps24-201ENSMUST00000181350 379 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC164567.4-201ENSMUST00000219708 483 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC173482.1-201ENSMUST00000224494 3815 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38069-201ENSMUST00000195360 2144 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Obscn-203ENSMUST00000052872 23006 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm24318-201ENSMUST00000104490 131 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms