Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm18984-201ENSMUST00000193998 1124 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm17956-201ENSMUST00000199931 838 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Crem-202ENSMUST00000049942 953 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr622-202ENSMUST00000213536 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Rpl26-ps5-201ENSMUST00000122220 439 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm15680-201ENSMUST00000161597 465 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm42976-201ENSMUST00000200313 222 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm6171-201ENSMUST00000220760 645 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC154838.1-201ENSMUST00000228944 911 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm43888-201ENSMUST00000204405 2587 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Cyp7a1-201ENSMUST00000029905 4172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 2810474O19Rik-208ENSMUST00000189837 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm25313-201ENSMUST00000101817 116 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm23287-201ENSMUST00000179427 116 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm23143-201ENSMUST00000180137 116 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms