Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm28994-201ENSMUST00000188556 621 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm37231-201ENSMUST00000191716 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm38159-202ENSMUST00000194145 621 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm37734-201ENSMUST00000194294 621 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm36941-202ENSMUST00000194799 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm38363-202ENSMUST00000195029 622 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm37378-202ENSMUST00000195795 621 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm37130-202ENSMUST00000195874 621 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Mir34b-201ENSMUST00000083558 84 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Dync2h1-204ENSMUST00000140466 14264 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Dach2-202ENSMUST00000113378 2089 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm37363-201ENSMUST00000192336 2233 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Akap4-201ENSMUST00000057101 2851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm14473-201ENSMUST00000122269 557 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm29774-201ENSMUST00000219270 436 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 AC154851.2-201ENSMUST00000222172 644 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Tas2r130-201ENSMUST00000067597 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Zfp644-203ENSMUST00000112695 1915 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm15916-201ENSMUST00000118355 736 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm29459-201ENSMUST00000191359 518 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Klk1b18-ps-201ENSMUST00000205780 167 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Vmn1r171-206ENSMUST00000227386 2570 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 4930533N22Rik-202ENSMUST00000206684 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Cav1-203ENSMUST00000115454 613 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Mir6345-201ENSMUST00000184286 128 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Rtf1A2AQ19 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms