Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 n-R5s151-201ENSMUST00000083959 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Olfr1454-203ENSMUST00000214695 4049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Olfr111-203ENSMUST00000215424 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm3526-201ENSMUST00000164544 1750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm44078-201ENSMUST00000204652 2646 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Ncr1-202ENSMUST00000126417 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm37124-201ENSMUST00000192140 1992 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Slco6d1-202ENSMUST00000160796 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Cdh7-209ENSMUST00000172005 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm22778-201ENSMUST00000104090 128 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm14908-201ENSMUST00000120930 1286 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm24383-201ENSMUST00000122691 333 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm11844-201ENSMUST00000129207 459 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm16230-201ENSMUST00000155550 521 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm3339-201ENSMUST00000163462 475 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Serpina3l-ps-201ENSMUST00000163975 1264 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm8265-201ENSMUST00000170469 475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r10-201ENSMUST00000176073 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Igkv13-57-1-201ENSMUST00000198063 305 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 4930598N05Rik-204ENSMUST00000207733 675 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm45458-201ENSMUST00000209900 522 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Olfr337-ps1-202ENSMUST00000213375 526 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm36501-201ENSMUST00000221857 745 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 BC048502-201ENSMUST00000065978 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm14890-201ENSMUST00000117660 676 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm15194-201ENSMUST00000120453 434 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm15905-201ENSMUST00000137042 298 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm23702-201ENSMUST00000158840 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm28471-201ENSMUST00000185994 615 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm28598-201ENSMUST00000186490 615 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm29268-201ENSMUST00000188669 615 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm29218-205ENSMUST00000190846 615 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm28978-201ENSMUST00000191120 615 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm37172-201ENSMUST00000191926 615 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm37631-201ENSMUST00000192275 364 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm38332-201ENSMUST00000194189 147 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Higd1aQ9JLR9 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms