Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Gm27315-201ENSMUST00000183977 154 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 4933438B17Rik-202ENSMUST00000196374 576 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm18258-201ENSMUST00000210413 542 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 AC123061.2-201ENSMUST00000226234 802 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Fbxw23-202ENSMUST00000198480 1388 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 4930505K14Rik-201ENSMUST00000155504 515 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm21999-201ENSMUST00000165985 387 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gtpbp4-ps2-201ENSMUST00000184058 256 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm4854-201ENSMUST00000185902 574 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 4930590L20Rik-201ENSMUST00000193820 553 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm37659-201ENSMUST00000194574 111 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Olfr1542-ps1-201ENSMUST00000204175 752 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm39232-201ENSMUST00000210760 1012 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 AC160635.2-201ENSMUST00000216368 734 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 AC156952.1-201ENSMUST00000220361 793 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Olfr1489-201ENSMUST00000053113 1111 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Olfr1105-201ENSMUST00000099868 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Olfr620-201ENSMUST00000052152 3157 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.44
Atg3Q9CPX6 Kcnh7-201ENSMUST00000075052 13321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Olfr635-202ENSMUST00000209473 8565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Gm3055-201ENSMUST00000105316 720 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Gm15379-201ENSMUST00000121224 648 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Gm15022-201ENSMUST00000122074 746 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Crem-219ENSMUST00000140332 1015 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Gm14637-201ENSMUST00000156516 444 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Gm23385-201ENSMUST00000158592 295 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Atg3Q9CPX6 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.8 ms