Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Fastkd2-201ENSMUST00000027103 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm37212-201ENSMUST00000192582 3650 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Serpinb11-201ENSMUST00000027566 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm45425-201ENSMUST00000211727 618 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm42492-201ENSMUST00000195780 2915 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Olfr1115-202ENSMUST00000213513 3604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Abcc9-203ENSMUST00000100827 7306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm5946-202ENSMUST00000182652 2724 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Xcr1-201ENSMUST00000182350 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm18011-201ENSMUST00000203717 565 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm44879-201ENSMUST00000207007 503 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Olfr436-ps1-201ENSMUST00000203108 284 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 AC122840.3-201ENSMUST00000221474 486 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Vmn1r214-203ENSMUST00000227652 3906 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Zfp184-205ENSMUST00000176511 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps67-201ENSMUST00000172624 385 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 AC122188.1-201ENSMUST00000217534 312 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Olfr1369-ps1-204ENSMUST00000215207 3794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprtQ99M80 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms