Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm18388-201ENSMUST00000222339 557 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 CT009550.5-201ENSMUST00000226286 382 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm7697-201ENSMUST00000201500 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Abcb5-201ENSMUST00000035515 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm17131-201ENSMUST00000164420 3846 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Olfr402-202ENSMUST00000216722 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Pcdh9-207ENSMUST00000195376 5096 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm7173-202ENSMUST00000114021 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm11970-201ENSMUST00000116105 320 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm12639-201ENSMUST00000121400 493 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 AC110380.1-201ENSMUST00000226987 389 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 AC139845.2-201ENSMUST00000227504 436 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm10115-201ENSMUST00000076071 1228 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Zfp287-201ENSMUST00000005399 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Abcb11-201ENSMUST00000102709 5025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Olfr107-204ENSMUST00000215974 2282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Olfr1173-201ENSMUST00000099830 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm13607-201ENSMUST00000117875 539 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm7312-201ENSMUST00000118798 469 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm15785-201ENSMUST00000119145 694 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Rps18-ps2-201ENSMUST00000119493 398 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm24211-201ENSMUST00000158264 107 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm27163-201ENSMUST00000184767 409 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Apobec3Q99J72 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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