Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm28889-201ENSMUST00000185350 959 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm8820-201ENSMUST00000204077 571 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 CT030184.2-201ENSMUST00000223064 263 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC117237.1-201ENSMUST00000224035 395 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm21244-202ENSMUST00000189201 3115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Nlgn1-202ENSMUST00000108308 4272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm11212-201ENSMUST00000118337 618 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr1423-202ENSMUST00000214472 5570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Celf2-203ENSMUST00000114923 529 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 1700019E08Rik-202ENSMUST00000153567 635 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm25820-201ENSMUST00000198589 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr968-201ENSMUST00000075928 1027 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 C2cd6-201ENSMUST00000097080 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr1292-ps1-201ENSMUST00000118137 939 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm5123-201ENSMUST00000121905 837 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm5755-201ENSMUST00000152394 837 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm13853-201ENSMUST00000155496 557 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Obox4-ps1-201ENSMUST00000184446 700 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Rhoay-ps3-201ENSMUST00000187648 576 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC115291.2-201ENSMUST00000228335 437 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Olfr364-ps1-202ENSMUST00000214905 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
NipblQ6KCD5 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm33051-201ENSMUST00000192940 274 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 AC131687.1-201ENSMUST00000225931 5446 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
NipblQ6KCD5 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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