Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 2010107E04Rik-201ENSMUST00000021719 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr430-202ENSMUST00000213425 3873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr738-203ENSMUST00000214853 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r218-203ENSMUST00000227050 10364 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 9030622O22Rik-201ENSMUST00000129082 1245 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12974-201ENSMUST00000129875 333 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21758-201ENSMUST00000179336 819 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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Pdzrn3Q69ZS0 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Pdzrn3Q69ZS0 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Pdzrn3Q69ZS0 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Pdzrn3Q69ZS0 4930532I03Rik-201ENSMUST00000218463 1724 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Pdzrn3Q69ZS0 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp456-201ENSMUST00000057070 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27317-201ENSMUST00000183533 95 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43171-201ENSMUST00000199882 291 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Pdzrn3Q69ZS0 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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