Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Slc25a40-202ENSMUST00000170496 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm11561-201ENSMUST00000117429 417 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm11403-201ENSMUST00000122195 369 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 1700025D23Rik-201ENSMUST00000129365 846 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Tnfsf13os-202ENSMUST00000144033 578 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Rps27-201ENSMUST00000170122 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm22548-201ENSMUST00000174899 78 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm19060-201ENSMUST00000201959 421 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Mir135a-1-201ENSMUST00000083473 90 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm43793-201ENSMUST00000201645 1333 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Tbcel-202ENSMUST00000066179 3893 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm42523-201ENSMUST00000199378 2872 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Olfr55-203ENSMUST00000214891 4428 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Etl4-209ENSMUST00000114627 7413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Zfp286os-201ENSMUST00000128292 713 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm23553-201ENSMUST00000157817 295 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm29082-201ENSMUST00000185207 448 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 4933432G23Rik-201ENSMUST00000213675 840 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm25937-201ENSMUST00000083912 107 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm2832-201ENSMUST00000172412 1760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm42898-201ENSMUST00000200370 3073 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm13083-201ENSMUST00000105773 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Olfr1312-204ENSMUST00000215531 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Lrp2-201ENSMUST00000080953 15460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Rab8b-201ENSMUST00000041139 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm11368-201ENSMUST00000139576 609 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm24100-201ENSMUST00000178592 79 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm20834-201ENSMUST00000179558 684 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 AC129219.1-201ENSMUST00000224336 448 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ecm2Q5FW85 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms