Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr270-203ENSMUST00000215010 2502 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Wdr64-201ENSMUST00000094288 3817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr310-202ENSMUST00000217724 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm11867-201ENSMUST00000133363 1909 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Sult2a5-201ENSMUST00000108525 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Rpl38-ps1-201ENSMUST00000117723 215 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm16318-201ENSMUST00000162402 601 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm18128-201ENSMUST00000172625 511 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 1700023G09Rik-202ENSMUST00000194671 308 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm5309-201ENSMUST00000197416 677 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Tas2r136-201ENSMUST00000065532 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Plac1-201ENSMUST00000074861 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 n-R5s152-201ENSMUST00000093641 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Lrp1b-208ENSMUST00000167270 10071 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm42843-201ENSMUST00000196328 3616 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr183-202ENSMUST00000206303 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 AC122382.2-201ENSMUST00000225128 3602 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Igkv1-133-201ENSMUST00000103304 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm4852-201ENSMUST00000121202 729 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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