Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm43655-201ENSMUST00000197367 222 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Usp39Q3TIX9 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm1720-201ENSMUST00000135086 1503 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm14885-201ENSMUST00000117969 496 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gas5-209ENSMUST00000159663 346 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm15810-201ENSMUST00000160241 681 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm17142-201ENSMUST00000164933 645 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 D830030K20Rik-202ENSMUST00000178670 441 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm22252-201ENSMUST00000179316 79 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm19280-201ENSMUST00000190191 205 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm34302-201ENSMUST00000192926 243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm19057-201ENSMUST00000194329 1197 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Fbxw15-203ENSMUST00000198397 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm8774-201ENSMUST00000203621 692 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 AC156801.2-201ENSMUST00000213613 487 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm6049-201ENSMUST00000222369 458 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Usp39Q3TIX9 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms