Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 H2al3-201ENSMUST00000057113 553 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr178-202ENSMUST00000206523 2095 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm44822-201ENSMUST00000208559 6389 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Ceacam2-201ENSMUST00000044547 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Kif20b-201ENSMUST00000087341 5564 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm5583-201ENSMUST00000174328 1519 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 4933413L06Rik-201ENSMUST00000110292 809 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Spata17-202ENSMUST00000110945 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Defa-ps15-201ENSMUST00000118178 477 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm13371-201ENSMUST00000137756 469 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Spink14-202ENSMUST00000162265 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm17657-201ENSMUST00000168877 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm9443-201ENSMUST00000188406 816 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm42796-201ENSMUST00000199913 1087 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr892-ps1-201ENSMUST00000211998 932 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC153729.2-201ENSMUST00000215166 560 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 4930520K02Rik-202ENSMUST00000219658 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 4930568D16Rik-201ENSMUST00000028243 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr346-201ENSMUST00000078854 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr578-202ENSMUST00000215606 3665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm37733-201ENSMUST00000195478 2962 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm15493-201ENSMUST00000119461 528 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm13232-201ENSMUST00000121816 632 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Tppp2-202ENSMUST00000177625 627 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm38832-201ENSMUST00000205674 400 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Trim71Q1PSW8 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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