Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Toporsl-201ENSMUST00000029995 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Ptprd-201ENSMUST00000050757 4698 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC133498.1-201ENSMUST00000222871 2925 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Nedd4-207ENSMUST00000184333 4034 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Olfr259-204ENSMUST00000216088 4023 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm28679-201ENSMUST00000186013 1499 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm28135-201ENSMUST00000186847 1499 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm28291-202ENSMUST00000186921 1499 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm29547-201ENSMUST00000187258 1499 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm28225-201ENSMUST00000187730 1499 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm29297-202ENSMUST00000188186 1499 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm28236-203ENSMUST00000188311 1499 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm29070-202ENSMUST00000188541 1499 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm29265-201ENSMUST00000188697 1499 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm28947-203ENSMUST00000188701 1499 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm28454-203ENSMUST00000190183 1495 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm28842-202ENSMUST00000190289 1499 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm28633-202ENSMUST00000190867 1485 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 B3gnt5-201ENSMUST00000079780 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Specc1-217ENSMUST00000202905 3841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Rfc1-206ENSMUST00000204965 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Clca3b-201ENSMUST00000159989 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Lrrtm4-206ENSMUST00000136421 4435 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm29502-201ENSMUST00000185979 3739 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 n-R5s19-201ENSMUST00000122793 120 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 1700007M16Rik-201ENSMUST00000129075 435 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm14216-201ENSMUST00000136046 409 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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Sh3bp2Q06649 Fbxw16-201ENSMUST00000084984 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Omd-202ENSMUST00000221170 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Pcdh11x-203ENSMUST00000113364 4454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Dennd2c-202ENSMUST00000172288 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Haus2-202ENSMUST00000110706 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm15023-201ENSMUST00000113183 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 AV320801-201ENSMUST00000068340 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm5751-201ENSMUST00000115561 444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm7429-201ENSMUST00000118664 348 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm12244-201ENSMUST00000119500 291 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm16161-201ENSMUST00000162239 290 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 4930556G22Rik-201ENSMUST00000185689 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Sh3bp2Q06649 4930562F17Rik-201ENSMUST00000195279 960 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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