Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm11168-203ENSMUST00000178348 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Vmn2r-ps16-201ENSMUST00000178737 377 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Vmn2r-ps15-201ENSMUST00000180112 377 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm20812-202ENSMUST00000189550 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm37898-201ENSMUST00000193781 174 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Igkv12-47-201ENSMUST00000196961 356 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr993-201ENSMUST00000099926 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm37041-201ENSMUST00000195873 3853 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Il1rl1-205ENSMUST00000174335 1216 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm37505-201ENSMUST00000195670 461 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm36259-201ENSMUST00000197340 392 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 4930563J15Rik-203ENSMUST00000219796 574 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 AC192088.2-201ENSMUST00000227590 411 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr112-205ENSMUST00000213274 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Olfr613-201ENSMUST00000106888 5139 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Pkp1P97350 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Olfr813-202ENSMUST00000204622 2410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Tenm1-203ENSMUST00000115059 12879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Sult1d1-201ENSMUST00000113314 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Gm13100-201ENSMUST00000117157 1439 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Gm11433-201ENSMUST00000118318 228 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Gm26487-201ENSMUST00000158022 94 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Pkp1P97350 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms