Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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VdrP48281 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 AC124601.1-201ENSMUST00000220531 135 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 S100pbp-202ENSMUST00000072431 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 Myo1b-204ENSMUST00000114541 4616 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 AC159896.3-201ENSMUST00000215904 3835 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm16344-201ENSMUST00000150084 1567 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 4922502D21Rik-201ENSMUST00000051283 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm44535-201ENSMUST00000208889 3136 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
VdrP48281 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
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VdrP48281 Lrrc4c-201ENSMUST00000059049 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
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VdrP48281 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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VdrP48281 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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VdrP48281 Gm14267-201ENSMUST00000119751 496 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
VdrP48281 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
VdrP48281 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
VdrP48281 1700093J21Rik-201ENSMUST00000143671 648 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
VdrP48281 G630016G05Rik-201ENSMUST00000152412 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
VdrP48281 Gm23228-201ENSMUST00000157296 270 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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