Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm44513-201ENSMUST00000206811 439 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Fth-ps3-201ENSMUST00000210405 358 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm45420-201ENSMUST00000211243 425 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 AC132465.3-201ENSMUST00000219326 195 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Cyp3a11-201ENSMUST00000035918 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Cdr1-201ENSMUST00000166381 2313 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Vmn1r171-203ENSMUST00000226321 3067 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Iqcm-202ENSMUST00000121983 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Xpo7-202ENSMUST00000167242 15121 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm29634-201ENSMUST00000188467 696 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm43586-201ENSMUST00000195948 310 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm40394-201ENSMUST00000221321 633 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Agtr2-201ENSMUST00000089188 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm16026-202ENSMUST00000159695 772 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Mir7669-201ENSMUST00000183442 58 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm6057-201ENSMUST00000195927 314 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Trim30e-ps1-201ENSMUST00000147064 1890 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Clec5a-202ENSMUST00000101491 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Olfr1176-202ENSMUST00000213778 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Dmxl2-202ENSMUST00000118600 9465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm32283-201ENSMUST00000218861 549 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 E330016L19Rik-201ENSMUST00000140614 1959 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Tcf12-207ENSMUST00000183918 4308 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 6720489N17Rik-202ENSMUST00000201563 2640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Bbox1-201ENSMUST00000046233 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm27308-201ENSMUST00000184807 233 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm45020-201ENSMUST00000205356 381 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm3565-201ENSMUST00000222670 609 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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