Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm11381-201ENSMUST00000138574 420 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Mir3110-201ENSMUST00000175053 80 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm27492-201ENSMUST00000185194 187 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm6657-203ENSMUST00000188791 531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm44376-201ENSMUST00000197570 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm44893-201ENSMUST00000207259 443 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC168880.1-201ENSMUST00000225113 707 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn1r36-202ENSMUST00000226635 918 ntAPPRIS P2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Mir188-201ENSMUST00000083464 68 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Defb25-201ENSMUST00000099203 293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm14014-201ENSMUST00000156718 2717 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm43312-201ENSMUST00000201655 2466 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Arhgef6-201ENSMUST00000033468 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm12423-201ENSMUST00000118334 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm12762-201ENSMUST00000140881 483 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 4930515L19Rik-201ENSMUST00000152352 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm5581-202ENSMUST00000204992 714 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 1700011L03Rik-201ENSMUST00000210613 608 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Lilrb4a-205ENSMUST00000217705 1142 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC153568.1-201ENSMUST00000218165 341 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm37652-201ENSMUST00000195290 2095 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
RxraP28700 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Igkv4-61-201ENSMUST00000103353 284 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Vmn1r120-201ENSMUST00000105202 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
RxraP28700 Gm22194-201ENSMUST00000116869 95 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms