Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
Gm20795J3QP49 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
Gm20795J3QP49 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
Gm20795J3QP49 Igkv15-103-201ENSMUST00000103324 375 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm24318-201ENSMUST00000104490 131 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm4660-201ENSMUST00000131499 403 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Tpo-203ENSMUST00000155263 664 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 4930445N08Rik-201ENSMUST00000156925 313 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm24217-201ENSMUST00000158260 133 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm6121-202ENSMUST00000167438 893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Obox4-ps23-201ENSMUST00000175738 1137 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Obox4-ps33-201ENSMUST00000176649 1139 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Obox4-ps22-201ENSMUST00000179602 1137 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Obox4-ps13-201ENSMUST00000180123 1137 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Zfp-ps-201ENSMUST00000185025 478 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm37241-201ENSMUST00000191736 523 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm42652-201ENSMUST00000199073 614 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm45096-201ENSMUST00000205833 427 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm24950-201ENSMUST00000082768 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm23971-201ENSMUST00000083317 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm23849-201ENSMUST00000083833 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm26316-201ENSMUST00000083886 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Rnu2-10-201ENSMUST00000084010 191 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm42481-201ENSMUST00000196822 2178 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Adam26a-201ENSMUST00000049577 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Olfr1317-203ENSMUST00000214801 2578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Vmn2r46-201ENSMUST00000171523 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Olfr714-203ENSMUST00000214429 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm13831-201ENSMUST00000118764 302 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm5379-201ENSMUST00000120973 826 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm16102-201ENSMUST00000160955 420 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 1700071M16Rik-201ENSMUST00000164150 537 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm18843-201ENSMUST00000194982 719 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Gm20795J3QP49 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms