Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr874-202ENSMUST00000216982 2632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm38278-201ENSMUST00000194715 1365 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Btbd35f14-201ENSMUST00000105117 1701 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm24683-201ENSMUST00000104840 88 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm7485-201ENSMUST00000119502 1109 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gtpbp4-ps5-201ENSMUST00000184969 289 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm7825-201ENSMUST00000204046 416 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm44781-201ENSMUST00000208480 601 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC164618.1-201ENSMUST00000225769 592 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr697-201ENSMUST00000050541 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Naalad2-207ENSMUST00000172171 4066 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gtdc1-203ENSMUST00000112810 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Zfand6-202ENSMUST00000178385 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Vmn1r35-204ENSMUST00000227749 2254 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Fastkd1-201ENSMUST00000073152 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm44625-201ENSMUST00000207838 1561 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Eif2s2-205ENSMUST00000166171 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm13991-201ENSMUST00000120190 648 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm25227-201ENSMUST00000158204 112 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps18-201ENSMUST00000177972 380 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm37308-201ENSMUST00000194684 100 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 5033403H07Rik-203ENSMUST00000198580 467 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm32754-202ENSMUST00000199504 480 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm19599-201ENSMUST00000218898 358 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm41002-201ENSMUST00000222479 312 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 AC141425.1-201ENSMUST00000224989 265 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Ssxb3-202ENSMUST00000089379 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Gm42658-201ENSMUST00000197199 1575 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 A730020M07Rik-202ENSMUST00000196621 2370 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Spocd1B1ASB6 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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