Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 2610024D14Rik-201ENSMUST00000121233 294 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm24960-201ENSMUST00000157923 90 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm7967-201ENSMUST00000190991 399 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC152062.1-201ENSMUST00000218129 386 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gtpbp8-201ENSMUST00000023348 836 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm22575-201ENSMUST00000082981 110 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 AC154329.1-201ENSMUST00000224408 3129 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Fsd1l-207ENSMUST00000180164 7340 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr665-203ENSMUST00000216257 2298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Grik3B1AS29 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Huwe1-202ENSMUST00000112622 14168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm8569-201ENSMUST00000117630 647 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm22383-201ENSMUST00000158188 327 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm42982-201ENSMUST00000198574 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr950-ps1-201ENSMUST00000213804 878 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm40477-202ENSMUST00000221505 881 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC102435.1-201ENSMUST00000222199 908 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr767-201ENSMUST00000082131 1086 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr944-203ENSMUST00000215306 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Vmn2r-ps40-201ENSMUST00000174438 2558 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 BB019430-202ENSMUST00000218015 1320 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm38407-202ENSMUST00000219221 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr1131-203ENSMUST00000216756 1459 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 1700017N19Rik-204ENSMUST00000188736 1709 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm42528-201ENSMUST00000200697 3418 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm24125-201ENSMUST00000104105 137 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Rpl23a-ps14-201ENSMUST00000118777 424 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Grik3B1AS29 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.8 ms