Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Morc2b-202ENSMUST00000131954 3857 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm14827-201ENSMUST00000146644 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm15228-201ENSMUST00000142044 3440 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 AC107742.1-201ENSMUST00000227769 1390 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Atp10b-201ENSMUST00000077659 6825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Serpinb3a-202ENSMUST00000112717 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm14915-201ENSMUST00000120747 204 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm14804-201ENSMUST00000122322 508 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 4930586N03Rik-201ENSMUST00000122940 881 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm16062-201ENSMUST00000151825 771 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm23069-201ENSMUST00000158240 311 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm25445-201ENSMUST00000158996 299 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 AC163664.2-201ENSMUST00000228894 459 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr1250-202ENSMUST00000111527 4386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Pcdh15-234ENSMUST00000191854 9104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Ppargc1a-203ENSMUST00000132734 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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Limd1Q9QXD8 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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Limd1Q9QXD8 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm27803-201ENSMUST00000183763 119 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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Limd1Q9QXD8 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Limd1Q9QXD8 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Vmn1r188-202ENSMUST00000226680 8374 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm44697-201ENSMUST00000207756 1679 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 AC159006.2-201ENSMUST00000228734 4144 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Ptprz1-204ENSMUST00000202102 4947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Sytl4-203ENSMUST00000113297 3306 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Cd200r4-202ENSMUST00000176321 2005 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Vmn2r98-201ENSMUST00000170424 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Rbmy-201ENSMUST00000100360 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm10256-202ENSMUST00000188114 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm21708-203ENSMUST00000190283 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Gm45601-201ENSMUST00000211483 6753 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 4930544M13Rik-202ENSMUST00000181553 1403 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Limd1Q9QXD8 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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