Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm45697-201ENSMUST00000212893 2876 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm14365-201ENSMUST00000117535 587 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm12577-201ENSMUST00000119701 574 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm6027-201ENSMUST00000121467 756 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Ufm1-202ENSMUST00000122330 637 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr405-ps1-202ENSMUST00000127098 711 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm12214-201ENSMUST00000151643 417 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r-ps55-201ENSMUST00000174634 392 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm22220-201ENSMUST00000082671 149 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 2700099C18Rik-204ENSMUST00000183133 1333 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr681-205ENSMUST00000216247 4729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm43829-201ENSMUST00000196191 3802 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm38091-201ENSMUST00000192418 3871 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Cd46-203ENSMUST00000162650 6288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Dock11-203ENSMUST00000115266 6047 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Senp8-206ENSMUST00000216329 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Vmn2r-ps149-201ENSMUST00000188423 590 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm43342-201ENSMUST00000201027 924 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm18320-201ENSMUST00000211304 595 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 AC153526.4-201ENSMUST00000217713 379 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Gm18387-201ENSMUST00000220333 702 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Higd1aQ9JLR9 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms