Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr996-201ENSMUST00000077075 1068 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Snord59a-201ENSMUST00000082844 74 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Obox4-ps27-201ENSMUST00000179203 1362 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Rmi1-204ENSMUST00000225815 2447 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm35629-201ENSMUST00000209684 2241 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm43886-201ENSMUST00000205039 2386 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr808-202ENSMUST00000203236 4523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 F630028O10Rik-201ENSMUST00000133125 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Tnpo1-201ENSMUST00000109399 8445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Mir190b-201ENSMUST00000104803 80 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 2210408F21Rik-206ENSMUST00000138653 417 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 Gm26727-201ENSMUST00000180773 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 1700042O05Rik-201ENSMUST00000219017 584 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 Mbd3l1-201ENSMUST00000069218 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Bco1Q9JJS6 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm13928-201ENSMUST00000120326 1732 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Adam25-201ENSMUST00000096663 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Vmn2r85-201ENSMUST00000171811 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr698-204ENSMUST00000216255 4024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Bco1Q9JJS6 4933416E14Rik-201ENSMUST00000130841 491 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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