Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr709-ps1-202ENSMUST00000215468 5078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC152981.1-201ENSMUST00000218320 2480 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Zfp984-202ENSMUST00000122309 2405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 1700027I24Rik-201ENSMUST00000183612 696 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm42539-201ENSMUST00000197009 308 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm8106-201ENSMUST00000213123 523 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr830-201ENSMUST00000078861 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr1100-201ENSMUST00000094913 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm35191-201ENSMUST00000200925 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm12067-201ENSMUST00000119755 1148 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm23441-201ENSMUST00000157268 127 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr1269-203ENSMUST00000216493 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr153-201ENSMUST00000217113 1258 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Slfn9-202ENSMUST00000092840 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Trappc13-205ENSMUST00000144060 3538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm37192-201ENSMUST00000194479 1348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm10444-201ENSMUST00000126708 148 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Vmn1r139-202ENSMUST00000173668 753 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Mir6398-201ENSMUST00000184541 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ccdc47Q9D024 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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