Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Olfr945-202ENSMUST00000216698 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm42991-201ENSMUST00000196468 3837 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Olfr1000-202ENSMUST00000213837 1915 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Olfr699-202ENSMUST00000215952 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm42645-201ENSMUST00000201573 1627 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Olfr2-203ENSMUST00000208147 6178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm18877-201ENSMUST00000207706 539 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Olfr1297-201ENSMUST00000099612 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Olfr1061-201ENSMUST00000099889 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Trav12d-2-201ENSMUST00000103593 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Trav12n-2-201ENSMUST00000103619 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Mir193b-201ENSMUST00000103784 79 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm25432-201ENSMUST00000158284 66 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm1979-202ENSMUST00000170224 666 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm21698-201ENSMUST00000178487 666 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm29044-202ENSMUST00000188980 300 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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Shmt2Q9CZN7 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 AC131117.2-203ENSMUST00000225886 950 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Olfr437-201ENSMUST00000060243 1018 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Klra7-203ENSMUST00000088011 921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
Shmt2Q9CZN7 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
Shmt2Q9CZN7 AI314180-203ENSMUST00000107557 4946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Shmt2Q9CZN7 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Shmt2Q9CZN7 Zfp989-202ENSMUST00000146688 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
Shmt2Q9CZN7 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Shmt2Q9CZN7 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
Shmt2Q9CZN7 CAAA01194877.1-201ENSMUST00000213137 4233 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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