Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 mt-Nd6-201ENSMUST00000082419 519 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm23464-201ENSMUST00000083145 147 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Olfr33-201ENSMUST00000084817 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Mtm1-213ENSMUST00000171933 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Sema3a-201ENSMUST00000030714 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 AC187103.2-201ENSMUST00000223605 1617 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Cdh10-202ENSMUST00000166873 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm45853-201ENSMUST00000212310 3171 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm24477-201ENSMUST00000157438 103 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Vmn1r196-204ENSMUST00000228382 6525 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 AI987944-201ENSMUST00000071804 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Mcmdc2-202ENSMUST00000118098 2072 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Mir761-201ENSMUST00000103245 76 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm15974-201ENSMUST00000159103 531 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm11007-201ENSMUST00000177700 195 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm2007-201ENSMUST00000177981 195 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm20830-201ENSMUST00000178016 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm2004-203ENSMUST00000179349 195 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm45839-201ENSMUST00000209884 399 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Vmn1r232-201ENSMUST00000077001 1159 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Tnrc6b-201ENSMUST00000067689 17332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Ago2-201ENSMUST00000044113 13705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Fam107b-209ENSMUST00000226435 3602 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Sde2Q8K1J5 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms