Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 AC117769.3-201ENSMUST00000225814 1664 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Clk4-202ENSMUST00000109111 1427 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm3020-201ENSMUST00000112801 450 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Mir466i-201ENSMUST00000116924 121 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm15297-201ENSMUST00000117795 290 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm24724-201ENSMUST00000158230 107 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm5777-201ENSMUST00000177265 448 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm20056-201ENSMUST00000194813 519 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm43368-201ENSMUST00000200638 409 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 CT030166.1-201ENSMUST00000222654 357 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Olfr504-201ENSMUST00000075595 958 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Bcl2a1a-201ENSMUST00000098485 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
Hoxa13Q62424 Gm31258-201ENSMUST00000194532 3297 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Vmn1r34-206ENSMUST00000228498 3078 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm43784-201ENSMUST00000202922 2436 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr1065-204ENSMUST00000217586 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Vmn1r115-201ENSMUST00000169374 888 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm20523-201ENSMUST00000174340 1124 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Mir6411-201ENSMUST00000183556 108 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm10292-202ENSMUST00000193165 585 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm44839-201ENSMUST00000206590 241 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm32975-201ENSMUST00000211651 584 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC156832.3-201ENSMUST00000215591 435 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm18557-201ENSMUST00000218710 433 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 AC112142.1-206ENSMUST00000228136 982 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Zfp143-201ENSMUST00000084727 3003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Olfr123-203ENSMUST00000216051 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
Hoxa13Q62424 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 176.7 ms