Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Calcrl-202ENSMUST00000099944 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm11939-201ENSMUST00000104931 300 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Defb5-201ENSMUST00000110763 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Clec4a3-202ENSMUST00000117173 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Trav6-4-202ENSMUST00000184650 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Kcnmb2-206ENSMUST00000194796 338 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm22711-202ENSMUST00000197029 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm43768-201ENSMUST00000198380 1258 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm45499-201ENSMUST00000211656 280 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 AC161884.2-201ENSMUST00000224513 227 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1253-202ENSMUST00000213484 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sft2d1Q5SSN7 Olfr736-202ENSMUST00000213402 2402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 4930503L19Rik-204ENSMUST00000212155 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Ssxb8-201ENSMUST00000101690 518 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm14161-201ENSMUST00000137020 339 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm23207-201ENSMUST00000158665 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-77-201ENSMUST00000170551 294 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm28709-201ENSMUST00000186967 456 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 AC132121.1-201ENSMUST00000220774 332 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 AC174459.2-201ENSMUST00000226036 160 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 AC116596.2-203ENSMUST00000227345 731 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gabrb2-205ENSMUST00000192403 1539 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Olfr898-202ENSMUST00000216304 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 A230004M16Rik-202ENSMUST00000139508 4468 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Sft2d1Q5SSN7 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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