Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr726-206ENSMUST00000217025 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Q3U6N9 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Q3U6N9 2210408I21Rik-201ENSMUST00000168779 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Q3U6N9 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Igkv4-70-201ENSMUST00000103348 379 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm24251-201ENSMUST00000157324 114 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 1700025F22Rik-202ENSMUST00000180678 658 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr134-202ENSMUST00000215900 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 AC159326.1-201ENSMUST00000219989 1302 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Vmn1r171-209ENSMUST00000228228 2863 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm6065-201ENSMUST00000081336 492 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Gm6043-201ENSMUST00000099961 492 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Q3U6N9 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm43920-201ENSMUST00000204953 2159 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Nfat5-202ENSMUST00000077440 12773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr1034-201ENSMUST00000213496 4882 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm38243-201ENSMUST00000194737 1567 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm43426-201ENSMUST00000197287 2597 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm15193-201ENSMUST00000120224 865 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Olfr343-ps1-201ENSMUST00000121883 303 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm8890-202ENSMUST00000177727 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm8926-202ENSMUST00000178158 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm8879-202ENSMUST00000178863 465 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm8922-202ENSMUST00000178989 465 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Speer1-202ENSMUST00000179482 465 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm8897-202ENSMUST00000179679 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm27286-201ENSMUST00000184934 179 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Q3U6N9 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms