Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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Rnf40Q3U319 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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Rnf40Q3U319 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Vpreb2-201ENSMUST00000075371 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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Rnf40Q3U319 Mgat4c-202ENSMUST00000120748 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm16503-201ENSMUST00000104964 3283 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Kcnj1-202ENSMUST00000172015 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Irgm1-202ENSMUST00000097271 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm44586-201ENSMUST00000207166 2737 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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Rnf40Q3U319 Mtpap-201ENSMUST00000025077 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Adam34-202ENSMUST00000212185 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Mef2c-203ENSMUST00000185052 3556 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Rnf40Q3U319 6330410L21Rik-201ENSMUST00000199846 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Rnf40Q3U319 Dclre1c-204ENSMUST00000115066 3828 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Rnf40Q3U319 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Rnf40Q3U319 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 n-R5s56-201ENSMUST00000082521 105 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Asb15-202ENSMUST00000117688 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
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Rnf40Q3U319 Olfr491-203ENSMUST00000214605 2136 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Ppip5k2-205ENSMUST00000171129 3425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Olfr495-202ENSMUST00000215215 2460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Rnf40Q3U319 Sytl2-206ENSMUST00000190731 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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Rnf40Q3U319 Olfr645-201ENSMUST00000057104 3677 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Gm21093-201ENSMUST00000084677 1710 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Abca4-207ENSMUST00000141135 3606 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Rnf40Q3U319 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms