Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Klra14-ps-201ENSMUST00000119532 802 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm24840-201ENSMUST00000122603 147 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 4932441J04Rik-201ENSMUST00000180708 729 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm37533-201ENSMUST00000193848 545 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Igkv12-40-201ENSMUST00000199208 347 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm45007-201ENSMUST00000206237 366 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Apoo-ps-201ENSMUST00000061241 586 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1170-201ENSMUST00000099831 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Rgs5-201ENSMUST00000027997 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Vmn1r84-201ENSMUST00000086228 2452 ntAPPRIS P2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm2099-202ENSMUST00000223310 3341 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1300-ps1-201ENSMUST00000208175 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Psmc6-201ENSMUST00000022380 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Slc22a22-202ENSMUST00000110196 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1487-205ENSMUST00000217061 4080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Wac-217ENSMUST00000172018 1965 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1323-202ENSMUST00000213463 3717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Ifit2-201ENSMUST00000102826 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm15752-201ENSMUST00000117427 394 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1035-ps1-201ENSMUST00000120109 966 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 CT030705.1-201ENSMUST00000223971 533 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm8724-201ENSMUST00000081668 483 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 n-R5s86-201ENSMUST00000083215 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Mapk8-203ENSMUST00000111943 1310 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Lin7c-201ENSMUST00000028583 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 4932411K12Rik-201ENSMUST00000190493 3156 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Fpgt-201ENSMUST00000066568 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Vmn1r200-202ENSMUST00000226157 5505 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm12889-201ENSMUST00000118684 241 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Tex50-201ENSMUST00000135643 1192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm24751-201ENSMUST00000157844 102 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps74-201ENSMUST00000174705 917 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm27033-201ENSMUST00000183226 544 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm28788-201ENSMUST00000189717 375 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm29558-201ENSMUST00000190134 375 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm37768-201ENSMUST00000192748 887 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim71Q1PSW8 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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