Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm4759-201ENSMUST00000183414 6622 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Vmn2r22-201ENSMUST00000170808 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm37717-201ENSMUST00000192647 3027 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 4933413L06Rik-202ENSMUST00000111588 922 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm13028-201ENSMUST00000128563 277 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm7846-201ENSMUST00000145844 274 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm7903-202ENSMUST00000179953 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Zfp287-206ENSMUST00000185656 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm29159-201ENSMUST00000187969 379 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm38075-201ENSMUST00000191979 920 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm43616-201ENSMUST00000199347 409 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm45249-201ENSMUST00000211021 348 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC122332.1-201ENSMUST00000214384 285 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Gm29968-201ENSMUST00000222815 1387 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr527-203ENSMUST00000214858 3362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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ptchd1Q14B62 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Mpc1-203ENSMUST00000130559 603 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm12065-201ENSMUST00000149592 656 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
ptchd1Q14B62 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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