Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Stk4-202ENSMUST00000088291 4098 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Rnf145-202ENSMUST00000101327 4214 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 4930544L04Rik-202ENSMUST00000211181 3204 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm25345-201ENSMUST00000104505 133 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm24586-201ENSMUST00000116695 89 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm16347-201ENSMUST00000131707 622 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gtsf1-204ENSMUST00000136480 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 S100a14-203ENSMUST00000199538 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm44571-201ENSMUST00000208092 533 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm45485-201ENSMUST00000211229 357 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm45829-201ENSMUST00000212466 334 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC123665.6-201ENSMUST00000228568 538 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm11885-201ENSMUST00000118473 1428 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC122024.1-201ENSMUST00000219276 4850 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm38026-201ENSMUST00000193284 3880 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm18796-201ENSMUST00000190440 1767 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 4930555F03Rik-202ENSMUST00000126285 3604 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Olfr1220-203ENSMUST00000213288 4223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Slc12a6-203ENSMUST00000110987 3722 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm25917-201ENSMUST00000104267 130 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Psmb6-ps-201ENSMUST00000117520 713 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Xlr5e-ps-201ENSMUST00000122043 711 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm24687-201ENSMUST00000157758 241 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm10933-201ENSMUST00000221891 1861 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AC159256.1-201ENSMUST00000224298 1039 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 AL589742.1-201ENSMUST00000226034 349 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Soat1-201ENSMUST00000051396 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Sh3bp2Q06649 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.4 ms