Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Olfr1195-201ENSMUST00000099818 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm43121-201ENSMUST00000199065 1305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Zfp65-201ENSMUST00000073157 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Vmn1r41-201ENSMUST00000204949 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Taok1-201ENSMUST00000017435 11813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Rev3l-207ENSMUST00000164763 10399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Pkhd1-201ENSMUST00000088448 12935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SrprbP47758 AC112274.1-201ENSMUST00000218957 4274 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Vmn1r-ps127-201ENSMUST00000118007 478 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm18448-201ENSMUST00000186286 599 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm42958-201ENSMUST00000197595 318 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm2762-205ENSMUST00000202366 356 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 4930567K12Rik-201ENSMUST00000207593 1281 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Olfr1073-ps1-202ENSMUST00000215705 478 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Olfr603-202ENSMUST00000218246 1021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 AC122508.1-201ENSMUST00000218365 233 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm29809-201ENSMUST00000218423 493 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 AC159238.1-201ENSMUST00000220699 343 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 1110012L19Rik-201ENSMUST00000053981 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm23452-201ENSMUST00000083327 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Vmn1r80-206ENSMUST00000228028 6918 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Olfr13-202ENSMUST00000216179 3677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SrprbP47758 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Med13-201ENSMUST00000043624 10546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm45872-201ENSMUST00000209804 1584 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 AC169985.1-201ENSMUST00000223648 2439 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm43000-201ENSMUST00000198482 3343 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm17021-202ENSMUST00000214413 2371 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 4932411K12Rik-203ENSMUST00000210384 1351 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Olfr198-202ENSMUST00000208244 2200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm14794-201ENSMUST00000118181 192 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm12677-201ENSMUST00000118668 426 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm13887-201ENSMUST00000119009 344 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm14322-202ENSMUST00000119838 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm14903-201ENSMUST00000122435 537 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm14418-202ENSMUST00000128657 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm11967-201ENSMUST00000135132 480 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm17160-201ENSMUST00000170645 260 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
SrprbP47758 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms