Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Dram2-201ENSMUST00000029507 1891 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Phex-201ENSMUST00000079945 6265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm42537-201ENSMUST00000198260 2574 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm9343-201ENSMUST00000209016 2609 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm16579-201ENSMUST00000161985 2566 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm24117-201ENSMUST00000103973 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm12807-201ENSMUST00000121546 962 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm22243-201ENSMUST00000178754 120 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm21820-201ENSMUST00000179056 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Cox6b2-206ENSMUST00000182738 423 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm43524-201ENSMUST00000197278 298 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm38825-201ENSMUST00000204022 648 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm7128-201ENSMUST00000211639 533 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 CT025617.1-201ENSMUST00000216487 725 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 AC138401.2-201ENSMUST00000220461 365 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm7093-201ENSMUST00000223004 581 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr677-201ENSMUST00000098161 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr1049-201ENSMUST00000099899 953 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rpl28P41105 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC120375.2-201ENSMUST00000226532 1853 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Arrdc3-201ENSMUST00000099356 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Rbbp8-202ENSMUST00000115861 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr290-202ENSMUST00000214501 5196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr290-204ENSMUST00000216367 5182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm5798-201ENSMUST00000164613 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm13788-201ENSMUST00000120767 601 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Ccdc34os-201ENSMUST00000123633 979 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 1700092C17Rik-201ENSMUST00000135792 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm25150-201ENSMUST00000157121 60 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm6904-201ENSMUST00000168702 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm29137-201ENSMUST00000190301 520 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Cyp3a63-ps-201ENSMUST00000196626 1170 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm43044-201ENSMUST00000198091 379 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr367-ps-203ENSMUST00000213819 541 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC134528.1-201ENSMUST00000219156 387 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr1026-201ENSMUST00000056718 965 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Ceacam11-201ENSMUST00000094799 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rpl28P41105 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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