Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 C530043A13Rik-201ENSMUST00000186453 550 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm4644-201ENSMUST00000197587 400 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm25200-201ENSMUST00000083094 130 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Mir370-201ENSMUST00000083499 79 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Btbd35f23-201ENSMUST00000189190 1943 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 AC167360.1-201ENSMUST00000222596 2494 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Vmn2r-ps119-201ENSMUST00000177481 2406 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm4736-201ENSMUST00000100870 380 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm27190-201ENSMUST00000184890 542 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Snhg14-207ENSMUST00000188162 770 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm36998-201ENSMUST00000193205 704 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Vmn1r22-202ENSMUST00000227650 3674 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Phc3-209ENSMUST00000168645 10976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprkP35822 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprkP35822 9330175M20Rik-201ENSMUST00000189867 2552 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
PtprkP35822 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprkP35822 4930406D18Rik-202ENSMUST00000152827 657 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprkP35822 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprkP35822 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm19219-201ENSMUST00000215863 724 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm272-201ENSMUST00000222073 919 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprkP35822 AC154727.1-201ENSMUST00000226537 499 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
PtprkP35822 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Nsd1-207ENSMUST00000224973 9905 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Sult1c2-201ENSMUST00000023886 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Olfr586-204ENSMUST00000215304 6169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm24008-201ENSMUST00000157733 138 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm28396-201ENSMUST00000190309 379 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 AC132324.1-201ENSMUST00000221855 584 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 AC154441.1-201ENSMUST00000223653 1006 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm37488-201ENSMUST00000195434 3374 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Olfr1238-203ENSMUST00000217237 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm37195-201ENSMUST00000192006 3018 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm10067-201ENSMUST00000179462 348 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm27158-201ENSMUST00000183813 238 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprkP35822 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Smgc-201ENSMUST00000088555 2977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Vmn1r220-203ENSMUST00000227679 7868 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
PtprkP35822 Vmn1r220-206ENSMUST00000228854 7854 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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